Point épidémiologique COVID-19 du 24 février 2022 : l’amélioration des indicateurs de la circulation du SARS-CoV-2 se confirme

En semaine 07 (du 14 au 20 février), la situation épidémiologique s’améliorait sur l’ensemble du territoire national et dans toutes les classes d’âge sur le plan de la circulation du SARS-CoV-2 et de son impact sur le système de soins. En effet, le R-effectif restait inférieur à 1 depuis trois semaines consécutives, et la baisse des taux d’incidence et de positivité se poursuivait, avec un taux d’incidence national qui est passé sous le seuil des 1 000 cas pour 100 000 habitants. Les admissions à l’hôpital étaient en diminution, de même que les admissions en services de soins critiques. Le nombre de décès liés à la COVID-19 restait élevé en semaine 07 mais diminuait depuis la semaine 06. Le sous-lignage BA.2 du variant Omicron poursuivait sa progression, sans impact sur la dynamique, favorable à ce jour. Au 22 février, 82,6% des 65 ans et plus et 74,3% des 80 ans et plus avaient reçu un rappel de vaccination. Dans ce contexte, il apparait nécessaire d’intégrer les mesures barrières aux habitudes de vie dans la perspective d’une approche globale de prévention (port du masque, lavage des mains, aération) afin de notamment protéger les personnes les plus vulnérables. Le suivi des autres mesures barrières préconisées, en particulier en cas de symptôme, de test positif ou de contact à risque, ainsi que l’adhésion au contact-tracing, demeurent essentiels pour préserver la dynamique favorable actuelle.

Poursuite de la diminution du taux d’incidence et du taux de positivité dans l’ensemble des classes d’âge

Au niveau national, le taux d’incidence diminuait toujours et passait sous le seuil des 1 000 cas pour 100 000 habitants (833, -39%). Cette diminution était observée dans toutes les classes d’âge. Moins de 80 000 cas étaient observés en moyenne chaque jour. Le taux de dépistage et le taux de positivité poursuivaient leur baisse dans toutes les classes d’âge.

En France métropolitaine, les tendances étaient similaires dans l’ensemble des régions. Seules trois régions avaient encore un taux d’incidence supérieur à 1 000 pour 100 000 habitants : le Grand Est, la Nouvelle-Aquitaine et l’Occitanie. En Outre-mer, le taux d’incidence diminuait dans l’ensemble des territoires. Il restait le plus élevé à La Réunion et en Martinique.

La baisse des nouvelles hospitalisations et admissions en soins critiques se confirme

Au niveau national, la diminution du nombre de nouvelles hospitalisations (-29%) et d’admissions en soins critiques (-30%) se poursuivait. Au 22 février, le nombre de patients hospitalisés en réanimation était inférieur au seuil de 3 000. Le nombre de décès était en diminution à l’hôpital et en ESMS (-24%). Une diminution de la surmortalité toutes causes semblait s’amorcer en semaine 06. En France métropolitaine, les taux hebdomadaires de nouvelles hospitalisations et de nouvelles admissions en soins critiques étaient en baisse dans toutes les régions à l’exception de la Corse où ces deux taux étaient stables. En Outre-mer, les taux de nouvelles hospitalisations et de nouvelles admissions en soins critiques étaient en diminution mais restaient élevés à La Réunion.

• Le Point sur les signalements d’infections à SARS-CoV-2 nosocomiales

Omicron représente 99,5 % des séquences interprétables et le sous-lignage BA.2 est en progression

En semaine 07, la dominance d’Omicron en France métropolitaine observée dans les données de criblage se confirme avec les données de séquençages de l’enquête Flash S06 (07/02) où il représentait 99,5% des séquences interprétables contre 99,4% dans l’enquête Flash S05 (31/01). Le VOC Delta ne représentait plus que 0,5% des séquences interprétables de l’enquête Flash S06. Le VOI B.1.640 n’a pas été détecté depuis Flash S02, mais des cas ont été identifiés hors enquêtes Flash jusqu’en semaine 06. Les données préliminaires de l’enquête Flash S07 (14/02) suivent les mêmes tendances d’augmentation d’Omicron par rapport à Delta. À ce jour, le VOC Omicron inclut, au sein du lignage parental B.1.1.529, trois sous-lignages : BA.1 (et son sous-lignage BA.1.1), BA.2 et BA.3. Les séquences d’Omicron identifiées en France appartiennent très majoritairement au sous-lignage BA.1 : 83% des 2 403 séquences Omicron de l’enquête Flash S06 correspondaient à BA.1, dont 51% à son sous-lignage BA.1.1. La proportion du sous-lignage BA.2 augmente à l’échelle nationale depuis début janvier : il représentait 4,8% des séquences Omicron de Flash S04 (24/01), 9,5% pour Flash S05, 16% de Flash S06 et 27% de Flash S07. La progression de BA.2 au détriment de BA.1 est observée dans toutes les régions de France métropolitaine, mais à des niveaux différents selon les régions.

Plus de 57% de la population générale a reçu une dose de rappel

Au 22 février 2022, l’estimation de la couverture vaccinale en population générale à partir de Vaccin Covid était de 79,2% pour une primo-vaccination complète et de 57,4% pour la dose de rappel. Parmi les 18 ans et plus, 71,9% avaient reçu une dose de rappel et 82,1% de ceux qui étaient éligibles au rappel à cette date l’avaient effectivement reçu. Parmi les 65 ans et plus, 82,6% avaient reçu une dose de rappel et 90,9% de ceux qui y étaient éligibles à cette date l’avaient reçu. En outre, 9,0% des enfants âgés de 10 à 11 ans avaient reçu une première dose de vaccin (3,0% pour les 5 à 9 ans). Du fait notamment d’actions de suppression de dossiers dans la base Vaccin Covid menées par la Caisse nationale d’assurance maladie, des baisses de couvertures vaccinales peuvent être observées.

Par ailleurs, Santé publique France la mise à jour de la surveillance des cas de Covide-19 chez les professionnels en établissement de santé, du bilan des activités de traçage des contacts et du bilan de la surveillance des cas de syndrome inflammatoire multi-systémique pédiatrique.