Recensement national des cas de COVID-19 chez les professionnels en établissements de santé

Depuis le 22 avril 2020, Santé publique France en lien avec le GERES et avec l’appui des CPIAS a mis en place une surveillance afin de recenser les professionnels exerçant en établissements de santé publics ou privés infectés par le coronavirus Sars-CoV-2.

Mis à jour le 12 mai 2022

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Face à l’épidémie de COVID-19, les professionnels travaillant en établissements de santé sont une population particulièrement exposée. Il est donc important de les suivre dans le cadre de la surveillance mise en place par Santé publique France. Par ailleurs, les  données actuellement disponibles au niveau national sont parcellaires et hétérogènes. C’est pourquoi, Santé publique France en partenariat avec le Geres (Groupe d'étude sur le risque d'exposition des soignants aux agents infectieux) et avec l’appui des CPias (Centre d’appui pour la prévention des infections associées aux soins), des équipes opérationnelles d'hygiène et de la médecine du travail ont élaboré un protocole de surveillance des professionnels salariés d’établissements de santé publics ou privés. En parallèle, le Geres a lancé sur son site internet un outil de recueil d’informations plus qualitatives, destiné à tous les professionnels de santé atteints par le coronavirus SARS-CoV-2, quels que soient leur profession et leur lieu d’exercice. 

Objectif

L’objectif de cette surveillance est de recenser le nombre de ces professionnels ayant été infectés par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020. 

Qui est concerné ?

Tous les établissements de santé d’hospitalisation publics et privés. 
Les informations recueillies concernent tous les professionnels salariés de ces établissements : professionnels de santé et autres salariés (personnels d'entretien, personnels administratif…).

Définition de cas

La définition de cas PES/COVID19 retenue pour l’enquête, est la suivante depuis le 9 novembre 2020 :

  • tout professionnel en établissement de santé (ES), symptomatique ou non, avec un résultat biologique confirmant l'infection par le SARS-CoV-2, par RT-PCR, ou par sérologie dans le cadre d'un diagnostic de rattrapage, conformément aux recommandations de la HAS, ou par un test antigénique (TROD ou TDR)
  • tout professionnel en établissement de santé probablement infecté par SARS-CoV-2, (clinique, historique de contact ou imageries évocatrices), reconnu comme infecté par la cellule « covid19» ou le référent infectiologue de l'ES.

Concernant les décès, il s'agit de décès liés à Covid-19.

Qui remplit le questionnaire ?

Une personne référente au sein de l’établissement (service de ressources humaines, médecine du travail, équipe opérationnelle d’hygiène…) est désignée pour remplir le questionnaire chaque semaine. Les données recueillies sont le nombre de professionnels ayant été infectés par le SARS-CoV-2 dans la semaine précédente, ventilé par catégorie professionnelle pour les soignants, ainsi que les décès liés à l’infection à SARS-CoV-2 rapportés parmi les professionnels infectés. 

Résultats clés au 12 avril 2022

Mise en place le 22 avril 2020, cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salariés d’un établissement de santé (PES) d’hospitalisation, public ou privé, ayant été infectés par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020. Ces données sont déclarées chaque semaine par un référent de chaque établissement, et susceptibles d’être corrigées a posteriori au cours de la période de surveillance.

  • 1 396 des 3 636 établissements de santé en France ont participé au moins une fois à l’enquête. Les établissements participants regroupent 950 920 professionnels salariés, ce qui correspond à 74,8% des PES salariés en France. La participation variait au cours du temps, elle était en moyenne de 600 établissements chaque semaine entre le 13 avril et le 28 juin 2020 (1ère vague). Au cours de la 5ème vague (du 8 novembre 2021 au 10 mai 2022), la participation moyenne chaque semaine est de 170 établissements (Figure 1)
  • Depuis le 12 avril 2022, 5 452 contaminations supplémentaires liées à la Covid-19 ont été déclarées chez les PES, portant à 135 660 le nombre de contaminations chez les PES pour la période du 1er mars 2020 au 10 mai 2022. La répartition actualisée du nombre hebdomadaire de cas déclarés montre deux pics lors de la 5ème vague en semaine S03-2022 et en S13-2022. Après le second pic, une diminution du nombre de cas a été observée à partir de la semaine S14-2022. Les données de la semaine S18-2022 ne sont pas consolidées (Figure 1).
  • Aucun décès supplémentaire lié à la COVID-19 n’a été déclaré depuis le dernier bilan. Au total, 19 décès liés à l’infection à SARS-CoV-2 ont été enregistrés depuis le 1er mars 2020, survenus chez 5 médecins, 5 aides-soignants, 1 infirmier, 2 professionnels de santé classés « autres » et 6 professionnels non soignants. Parmi les décès déclarés, aucun n’est survenu depuis mi-décembre 2020.
  • Parmi les 135 660 cas, 85 396 (63%) étaient des professionnels soignants et 15 533 (11%) des professionnels non soignants. Pour 26% des cas, la catégorie professionnelle n’était pas renseignée.
  • Les 2 professions le plus souvent rapportées sont les infirmiers (N=30 351, 22,4% des cas) et les aides-soignants (N=24 217, 17,9% des cas).
  • Les aides-soignants et les kinésithérapeutes sont les professions les plus impactées par la pandémie de Covid-19 avec respectivement 14,4% et 13,3% des effectifs globaux par catégorie professionnelle.
  • Parmi les 73 253 cas pour lesquels le service d’exercice pendant les 2 semaines précédant l’infection a été renseigné, la majorité avait travaillé dans les services MCO (N=30 007, 41%), les services médicotechniques (N= 20 991, 28,7%) ou les services de SSR/SLD (10 773, 14,7%). 12,8% des PES avaient travaillé dans d’autres types de services.
  • Au cours de la 5ème vague de l’épidémie (à partir de la S45-2021), sur les 343 établissements participant à l’enquête, la catégorie professionnelle « autres professionnels de santé » (Technicien de laboratoire, cadre de santé des services médicotechniques…) apparait comme la catégorie professionnelle la plus contaminée avec une proportion de contamination égale à 14,9%, suivie par les infirmiers (13,5%), les aides-soignants (12,8%) et les kinésithérapeutes (12,4%).
  • A partir de la S45-2021, les régions qui apparaissent les plus touchées par la pandémie sont les Pays de la Loire avec 28,1% des PES appartenant aux ES participants à l’enquête sont contaminés par la Covid-19, suivie par la région Nouvelle Aquitaine (25,7%) et la région Normandie (24,5%). (Figure 2).
Figure 1. Nombre de PES atteints de COVID-19 déclarés dans les ES, par semaine et nombre d’ES participants, depuis le 20 juillet 2020 (N=102 070), France (données au 10 mai 2022)
Figure 1. Nombre de PES atteints de COVID-19 déclarés dans les ES, par semaine et nombre d’ES participants, depuis le 20 juillet 2020 (N=102 070), France (données au 10 mai 2022)

Tableau 1 : Nombre et proportion de PES-COVID-19 infectés, par catégorie professionnelle, parmi les PES des ES participants depuis le 1er Mars 2020 (N= 132 293 données au 10 mai 2022), France

Catégorie professionnelleNombre de cas% parmi les PES
Infirmier30 35111,7
Aide-soignant24 21714,4
Médecin7 5518,3
Interne2 9348,9
Kinésithérapeute1 01713,3
Sage-femme9087,1
Autre professionnel soignant15 05111,6
Autre professionnel non soignant15 5336,2
Inconnu34 731ND
Total132 29313,9

*Source de données pour le nombre total de professionnels par catégorie professionnelle par région : SAE, données 2019 https://www.sae-diffusion.sante.gouv.fr/sae-diffusion/accueil.htm 

Nb1 : Les cas survenus parmi la catégorie professionnelle « élèves » (N= 3 367) n’ont pas été pris en compte dans cette analyse, en l’absence de dénominateur connu.
Nb2 : Le nombre d’inconnus dans le tableau ci-dessus (N= 34 731) est expliqué par le fait que la catégorie professionnelle est une variable optionnelle qui n’est pas remplie par tous les ES participants.

Tableau 2. Répartition par service des PES déclarés infectés par le SARS-CoV-2, depuis le 13 avril 2020 (données au 10 mai 2022, N=111 282), France.

ServiceNombre de PES infectés%
Médecine hors réanimation22 48120,2
Chirurgie5 6805,1
Obstétrique1 8461,7
Réanimation2 1421,9
Soins de suite et réadaptation6 1775,6
Soins de longue durée4 5964,1
Médico-technique20 99118,9
Autre9 3408,4
Inconnu38 02934,2
Total111 282100,0

Nb : Le nombre d’inconnus dans le tableau ci-dessus (N=38 029) est expliqué par le fait que le type de service est une variable optionnelle qui n’est pas remplie par tous les ES participants.

Source de données pour le nombre total de professionnels par catégorie professionnelle par région : SAE, données 2019 https://www.sae-diffusion.sante.gouv.fr/sae-diffusion/accueil.htm  

SSR : soins de suite et réadaptation
SLD : soins de longue durée

Figure 2. Répartition régionale des proportions de PES infectés pendant la 5e vague de la pandémie COVID-19, France (données au 10 mai 2022, N=51 342)
Figure 2. Répartition régionale des proportions de PES infectés pendant la 5e vague de la pandémie COVID-19, France (données au 10 mai 2022, N=51 342)Figure 2. Répartition régionale des proportions de professionnels travaillant en établissements de santé infectés pendant la cinquième vague de la pandémie COVID-19, France (données au 12 avril 2022, N=45 890)

Discussion

Cette surveillance spécifique permet de suivre le nombre et la proportion de professionnels travaillant en établissements de santé, ayant été infectés par le SARS-Cov2 depuis le début de la pandémie de COVID-19. Elle rapporte que 135 660 PES ont été infectés dans les ES participants. Après le second pic de la 5ème vague en semaine S13-2022, on observe une diminution du nombre de cas à partir de la S14-2022. Cette évolution est cohérente avec la dynamique de la pandémie en population générale.

  • La participation des ES a beaucoup varié au cours du temps et ne permet pas une comparaison directe du nombre de cas recensés lors des différentes vagues. Parmi les 1 396 ES qui ont participé à l’enquête depuis le 1er mars 2020, environ 150 ES y participent actuellement régulièrement. Le nombre d’ES participant diminue depuis la semaine S04-2022.
  • Depuis le début de l’épidémie, les infirmiers et les aides-soignants sont les professions le plus souvent atteintes. Relativement à l’ensemble des professionnels de leur catégorie parmi les ES participants, les aides-soignants et les kinésithérapeutes sont les professions les plus impactées depuis le début de l’épidémie (respectivement 14,4% et 13,3%).
  • Depuis la semaine S45-2021, les régions Pays de la Loire, Nouvelle Aquitaine et Normandie apparaissent comme les régions les plus impactées par la Covid-19 chez les PES.

Il est crucial de maintenir cette surveillance, de rappeler l’importance des gestes barrières en ES et de continuer à promouvoir la vaccination de cette population particulièrement exposée à l’infection au SARS-COV2. En effet, au 10 mai 2022, la couverture vaccinale des PES ayant reçu au moins une dose est estimée à 94,4%. La couverture vaccinale des PES pour la vaccination complète est estimée à 93,8% et la couverture vaccinale du rappel est estimée à 77,9%. (Données de CV issues de Vaccin COVID).

Par ailleurs, dans le cadre de la campagne de vaccination contre la grippe saisonnière et la campagne de rappel de vaccination contre la Covid-19, une enquête est mise en œuvre par Santé publique France afin d’évaluer les couvertures vaccinales contre la grippe et la COVID-19 chez les professionnels exerçant en établissements de santé. Le 1er point de mesure de cette enquête a eu lieu du 17 novembre au 1er décembre 2021 et les résultats sont disponibles sur le site internet de Santé publique France. Le deuxième point de mesure s’est déroulé du 1er au 15 mars 2022.